行政院長林全相當關心此一事件，不僅親赴醫院探視傷者，更立即指示交通部長賀陳旦、警政署長陳國恩、國土安全辦公室副主任黃俊泰前往現場處理；內政部、交通部與衛福部，亦在中央災害應變中心成立緊急應變專案小組，處理相關救援事宜。

刑事局偵五大隊第一隊隊長李子文，在案發現場受訪時證實：在車廂中找到破裂鋼管爆裂物及黑色帆布登山背包，初步判定就是爆炸點。李子文說，案發後，鑑識人員進入第六節車廂檢視，在座位上發現寬6公分、長15公分的破裂鋼管，地上也有鋼管碎裂痕跡，由於找不到任何開關，初步研判應是點火式爆裂物，而一旁則有黑色帆布背包。根據背包損壞情況來判斷，破裂的鋼管可能是放在背包裡爆炸，但確切的狀況，還是需要進一步調查。但可以確認的是，這起爆炸案並非機械故障所引發的意外事件，而是一起人為的爆炸案件！

恐怖組織ISIS(伊斯蘭國)2015年11月25日釋出影片「永不停歇」（No Respite）時，將矛頭指向反抗ISIS的60個國家成員，而曾被歐巴馬點名是反恐夥伴的台灣也在影片當中 。而此次爆炸案後，蔡政府啟動為了預防恐攻而成立的「國土安全辦公室」，使各方揣測甚囂塵上，台灣是否真的出現了首起的「恐怖攻擊事件」？雖然相關單位都表示未曾接獲任何情資而無法證實，但卻是中華民國政府及人民都需要持續密切注意、觀察且戒備的重要方向！